1.由于臭氧比氯有较高的氧化电位，比氯消毒具有更强的杀菌作用，对细菌的作用比氯快，消耗量明显较小，例如，在0.45mg/L臭氧作用下，经过2min后脊髓灰质炎病毒死亡，如果用氯消毒，则剂量为2mg/L时需经过3h。
2.臭氧消毒在很大程度上不受pH值的影响；
3.在某些特定的用水中，如食品加工、饮料生产以及微电子工业等，臭氧消毒不需要从已净化的水中去除过剩杀菌剂的附加工序，如用氯消毒时的脱氯工序。
4.不会产生象氯酚那样的臭味；
5.不会产生三卤甲烷等氯消毒的副产物；
6. 缺点：大量研究表明，含有机物污染的水经臭氧处理后，有可能将致突变物或THMS（三氯甲烷）的前体物如腐殖酸等大分子有机物分解成分子较小的有可能致突变物；水中含有氨氮时，在臭氧投量有限的情况下，臭氧不可能去除氨氮，有可能把有机氨氮氧化为氨氮，致使水中氨氮含量增高。因此，在使用臭氧时，应注意解决可能产生的问题。
7.臭氧在水中不稳定，容易消失，不能在管网中继续保持杀菌能力，故在臭氧消毒后，往往需要投加少量氯，以保持水中一定的余氯量；
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