1、报关注册登记条件不同：
（1）报关企业：必须具备有规定的设立条件并取得海关报关注册登记许可。
（2）进出口货物收发货人：直接向海关申请办理报关单位注册登记手续。
2、他们的注册登记的程序有所不同：
（1）报关企业注册登记程序：
报关企业在办理报关注册登记之前，须向海关申请办理注册登记许可手续，然后再向海关申请办理报关单位的注册登记手续。即：向海关申请办理“报关企业注册登记许可”——到工商行政管理部门办理许可经营项目登记——到所在地海关办理注册登记手续 。
（2）对进出口货物收发货人，不需要经过“申请办理注册登记许可手续”程序，直接向海关申请办理报关单位注册登记手续。
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